Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms