Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FOXQ1Q9C009 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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