Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms