Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms