Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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