Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms