Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms