Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms