Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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