Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.077e-6■■□□□ 11.7
DGCR8Q8WYQ5 MTA1-216ENST00000498644 871 ntTSL 215.37■□□□□ 0.057e-6■■□□□ 11.7
DGCR8Q8WYQ5 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.037e-6■■□□□ 11.7
DGCR8Q8WYQ5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.037e-6■■□□□ 11.7
DGCR8Q8WYQ5 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.277e-6■■□□□ 11.7
DGCR8Q8WYQ5 TSPAN4-220ENST00000532375 518 ntTSL 513.3□□□□□ -0.287e-6■■□□□ 11.7
DGCR8Q8WYQ5 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.357e-6■■□□□ 11.7
DGCR8Q8WYQ5 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.787e-6■■□□□ 11.7
DGCR8Q8WYQ5 ZNF217-203ENST00000431687 779 ntTSL 56.53□□□□□ -1.367e-6■■□□□ 11.7
DGCR8Q8WYQ5 ZNF217-205ENST00000540425 568 ntTSL 35.99□□□□□ -1.457e-6■■□□□ 11.7
DGCR8Q8WYQ5 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.26□□□□□ -2.371e-323■■□□□ 11.7
DGCR8Q8WYQ5 FASTK-213ENST00000482806 1826 ntTSL 523.15■■□□□ 1.31e-6■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 FASTK-215ENST00000489884 1751 ntTSL 1 (best)22.3■■□□□ 1.161e-6■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.131e-6■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.051e-6■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 FASTK-216ENST00000496663 818 ntTSL 220.52■□□□□ 0.881e-6■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.81e-6■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 FASTK-205ENST00000461979 720 ntTSL 519.93■□□□□ 0.781e-6■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.511e-6■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 FASTK-204ENST00000460980 1521 ntTSL 516.24■□□□□ 0.191e-6■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.145e-17■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 CTSB-229ENST00000533572 975 ntTSL 317.14■□□□□ 0.333e-8■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 CTSB-215ENST00000528965 556 ntTSL 314.06□□□□□ -0.163e-8■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.863e-8■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.23e-8■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 GFPT1-204ENST00000494201 625 ntTSL 56□□□□□ -1.453e-8■■□□□ 11.6
DGCR8Q8WYQ5 CLU-205ENST00000519742 583 ntTSL 318.04■□□□□ 0.484e-29■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.434e-29■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 CLU-207ENST00000520796 737 ntTSL 517.48■□□□□ 0.394e-29■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 CLU-206ENST00000520491 580 ntTSL 314.3□□□□□ -0.124e-29■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 CLU-217ENST00000560566 1039 ntTSL 413.14□□□□□ -0.314e-29■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.384e-29■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.712e-8■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 TP73-AS1-209ENST00000636630 2529 ntTSL 516.85■□□□□ 0.292e-8■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 TP73-AS1-204ENST00000452079 6358 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.052e-8■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 TP73-AS1-201ENST00000418088 3329 ntTSL 1 (best)12.44□□□□□ -0.422e-8■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 TP73-AS1-205ENST00000587071 737 ntTSL 49.67□□□□□ -0.862e-8■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.819e-9■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 MTA1-210ENST00000481012 987 ntTSL 514.56□□□□□ -0.083e-6■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 MTA1-204ENST00000424723 904 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.213e-6■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.136e-12■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.216e-12■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.292e-13■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 AMD1-202ENST00000368877 1605 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.852e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.232e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 AMD1-205ENST00000451850 3121 ntTSL 1 (best)6.73□□□□□ -1.332e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.372e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.372e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.163e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.393e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 FADS3-208ENST00000529404 2379 ntTSL 216.47■□□□□ 0.233e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 FADS3-211ENST00000533676 5314 ntTSL 215.49■□□□□ 0.073e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 FADS3-210ENST00000531956 841 ntTSL 514.84□□□□□ -0.033e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 FADS3-206ENST00000527379 768 ntTSL 314.49□□□□□ -0.093e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 FADS3-212ENST00000534223 800 ntTSL 511.01□□□□□ -0.653e-7■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.423e-6■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.383e-6■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.263e-6■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 CNN3-203ENST00000415017 792 ntTSL 213.4□□□□□ -0.263e-6■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 AC009133.1-204ENST00000569809 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.663e-6■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 CNN3-205ENST00000474409 544 ntTSL 38.39□□□□□ -1.073e-6■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 ASPSCR1-203ENST00000344865 1041 ntTSL 219.6■□□□□ 0.734e-13■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 ASPSCR1-209ENST00000581484 1001 ntTSL 215.72■□□□□ 0.114e-13■■□□□ 11.5
DGCR8Q8WYQ5 FTCD-211ENST00000494498 840 ntTSL 318.4■□□□□ 0.544e-8■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 FTCD-206ENST00000460011 1260 ntTSL 1 (best)17.75■□□□□ 0.434e-8■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.471e-7■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 HMGA2-207ENST00000537275 1508 ntTSL 1 (best)24.23■■□□□ 1.471e-7■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 HMGA2-208ENST00000537429 1527 ntTSL 1 (best)24.23■■□□□ 1.471e-7■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.451e-7■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.351e-7■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.051e-7■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.021e-7■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 HMGA2-211ENST00000545998 1584 ntTSL 1 (best)19.95■□□□□ 0.781e-7■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-7■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.031e-7■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 318.4■□□□□ 0.541e-7■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.366e-6■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.451e-6■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.321e-6■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 UPF3A-206ENST00000480362 965 ntTSL 517.88■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 UPF3A-203ENST00000474056 748 ntTSL 316.59■□□□□ 0.251e-6■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 UPF3A-208ENST00000484246 699 ntTSL 315.29■□□□□ 0.041e-6■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 UPF3A-204ENST00000475218 1791 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.361e-6■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 UPF3A-210ENST00000493727 937 ntTSL 512.07□□□□□ -0.481e-6■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 UPF3A-205ENST00000479712 423 ntTSL 23.99□□□□□ -1.771e-6■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 UPF3A-207ENST00000481131 678 ntTSL 33.38□□□□□ -1.871e-6■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 TAF1D-217ENST00000532455 565 ntTSL 414.31□□□□□ -0.124e-8■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 TAF1D-211ENST00000529508 538 ntTSL 214.16□□□□□ -0.144e-8■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 TAF1D-208ENST00000527690 335 ntTSL 32.25□□□□□ -2.054e-8■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 FTCD-208ENST00000480950 318 ntTSL 323.91■■□□□ 1.423e-14■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 FTCD-207ENST00000469240 458 ntTSL 318.77■□□□□ 0.63e-14■■□□□ 11.4
DGCR8Q8WYQ5 GPX4-202ENST00000585362 859 ntTSL 224.49■■□□□ 1.512e-6■□□□□ 11.3
DGCR8Q8WYQ5 ETS2-203ENST00000432278 1033 ntTSL 519.05■□□□□ 0.643e-8■□□□□ 11.3
DGCR8Q8WYQ5 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.163e-8■□□□□ 11.3
DGCR8Q8WYQ5 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.443e-8■□□□□ 11.3
DGCR8Q8WYQ5 RDX-213ENST00000532461 3286 ntTSL 1 (best)6.42□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 11.3
DGCR8Q8WYQ5 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.227e-13■□□□□ 11.2
DGCR8Q8WYQ5 PALLD-201ENST00000261509 5809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.667e-13■□□□□ 11.2
DGCR8Q8WYQ5 PALLD-208ENST00000507699 3829 ntTSL 1 (best)5.72□□□□□ -1.497e-13■□□□□ 11.2
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