Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms