Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PARP8Q8N3A8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARP8Q8N3A8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARP8Q8N3A8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARP8Q8N3A8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARP8Q8N3A8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARP8Q8N3A8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms