Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACE1Q8IYU2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms