Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW8

SPNS2, Protein spinster homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2Q8IVW8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPNS2Q8IVW8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS2Q8IVW8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms