Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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