Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2R2Q712K3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2R2Q712K3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms