Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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