Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms