Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR44Q5JSH3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms