Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms