Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC14Q49A88 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms