Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms