Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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