Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms