Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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