Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK7Q16549 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms