Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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