Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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