Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZIC1Q15915 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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