Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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NPTX1Q15818 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NPTX1Q15818 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NPTX1Q15818 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NPTX1Q15818 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NPTX1Q15818 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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NPTX1Q15818 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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