Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms