Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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UBE3CQ15386 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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UBE3CQ15386 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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