Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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