Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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