Protein–RNA interactions for Protein: Q14289

PTK2B, Protein-tyrosine kinase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2BQ14289 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTK2BQ14289 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms