Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms