Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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CNGB1Q14028 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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CNGB1Q14028 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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CNGB1Q14028 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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CNGB1Q14028 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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