Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms