Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PKP1Q13835 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PKP1Q13835 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PKP1Q13835 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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