Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA9Q13797 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms