Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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TUBA3CQ13748 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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TUBA3CQ13748 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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TUBA3CQ13748 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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