Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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