Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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