Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CAMK2DQ13557 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms