Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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