Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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LSAMPQ13449 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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LSAMPQ13449 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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LSAMPQ13449 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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LSAMPQ13449 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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LSAMPQ13449 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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