Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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