Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 HNRNPC-212ENST00000554539 748 ntTSL 510.56□□□□□ -0.729e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.729e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.839e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.919e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-229ENST00000557157 698 ntTSL 55.14□□□□□ -1.599e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.819e-62■□□□□ 10
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PABPC4Q13310 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.831e-40■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.153e-32■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 MRPL20-205ENST00000492508 588 ntTSL 213.02□□□□□ -0.334e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 TSPAN14-206ENST00000372164 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.563e-32■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.33e-32■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.252e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.232e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.232e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.152e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 IMPDH1-207ENST00000469328 2295 ntTSL 515.66■□□□□ 0.12e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 IMPDH1-211ENST00000484496 2422 ntTSL 514.83□□□□□ -0.042e-8■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.624e-11■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 NUP160-209ENST00000530326 4811 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.89□□□□□ -1.311e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 SNRPA-211ENST00000601545 695 ntTSL 525.45■■□□□ 1.661e-10■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 SNRPA-210ENST00000601393 969 ntTSL 320.03■□□□□ 0.81e-10■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ATP1B3-209ENST00000487199 421 ntTSL 34.3□□□□□ -1.724e-21■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.58■□□□□ 0.891e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.282e-17■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.082e-17■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 SLC43A3-205ENST00000525205 862 ntTSL 313.07□□□□□ -0.322e-17■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 CHPT1-204ENST00000549128 1552 ntTSL 530.79■■■□□ 2.523e-7■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.353e-7■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 CHPT1-206ENST00000550385 754 ntTSL 512.25□□□□□ -0.453e-7■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 GNB1-207ENST00000472614 708 ntTSL 227.14■■□□□ 1.944e-7■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 SON-217ENST00000478183 1818 ntTSL 1 (best)10.56□□□□□ -0.721e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 59.38□□□□□ -0.911e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.361e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 HSBP1-202ENST00000567382 889 ntTSL 229.51■■■□□ 2.314e-9■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 PI4KA-202ENST00000399213 1636 ntTSL 519.58■□□□□ 0.723e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 PI4KA-207ENST00000466772 3109 ntTSL 215□□□□□ -0.013e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 PI4KA-209ENST00000477245 3026 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.083e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 PI4KA-217ENST00000492581 3925 ntTSL 212.69□□□□□ -0.383e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 HSBP1-203ENST00000569301 551 ntTSL 25.69□□□□□ -1.55e-9■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.372e-14■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 SMIM12-204ENST00000446026 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.853e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ETFA-215ENST00000560595 917 ntTSL 1 (best)24.25■■□□□ 1.473e-10■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ETFA-218ENST00000560899 910 ntTSL 520.64■□□□□ 0.893e-10■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 DNPEP-204ENST00000373966 1875 ntTSL 525.38■■□□□ 1.653e-7■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 DNPEP-203ENST00000373963 1657 ntTSL 523.76■■□□□ 1.393e-7■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 NT5DC2-209ENST00000478091 590 ntTSL 322.38■■□□□ 1.174e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 NT5DC2-213ENST00000489316 772 ntTSL 519.04■□□□□ 0.644e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.214e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.013e-7■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.023e-7■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 DNPEP-214ENST00000490371 555 ntTSL 514.11□□□□□ -0.153e-7■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 URM1-205ENST00000470840 723 ntTSL 215.5■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 PA2G4-206ENST00000552766 1085 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 RPS3A-203ENST00000505243 614 ntTSL 322.75■■□□□ 1.231e-8■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 RPS3A-202ENST00000503002 480 ntTSL 316.85■□□□□ 0.291e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 RPS3A-207ENST00000508783 587 ntTSL 316.26■□□□□ 0.191e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 RPS3A-206ENST00000507485 1526 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.651e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.741e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.261e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 RPS3A-214ENST00000515818 572 ntTSL 57.18□□□□□ -1.261e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.341e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 RPS3A-211ENST00000512797 686 ntTSL 26.35□□□□□ -1.391e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.621e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 RPS3A-213ENST00000515792 671 ntTSL 34.94□□□□□ -1.621e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 RPS3A-205ENST00000507327 674 ntTSL 23.86□□□□□ -1.791e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.752e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ACTR10-202ENST00000545307 1602 ntTSL 523.26■■□□□ 1.312e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ACTR10-204ENST00000554402 1544 ntTSL 1 (best)22.8■■□□□ 1.242e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.174e-7■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ACTR10-207ENST00000555229 1517 ntTSL 521.79■■□□□ 1.082e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 WDTC1-204ENST00000472249 628 ntTSL 520.4■□□□□ 0.862e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.52e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.52e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 MRPL24-203ENST00000412846 514 ntTSL 318.12■□□□□ 0.492e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ADSL-222ENST00000637669 1927 ntTSL 517.96■□□□□ 0.472e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 316.88■□□□□ 0.292e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.242e-8■□□□□ 9.9
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