Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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CBX3Q13185 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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CBX3Q13185 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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