Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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